Citation Management

• Вы создаёте или приводите в порядок библиографию для рукописи, диссертации или обзора литературы и вам необходимо массово преобразовывать DOI, PMID или arXiv ID в правильно отформатированные записи BibTeX.
• Вам нужно программно выполнять поиск в Google Scholar или PubMed — включая фильтрацию по диапазону дат, типу публикации или терминам MeSH — и экспортировать результаты непосредственно в BibTeX.
• У вас есть существующий файл BibTeX, который перед отправкой требует дедупликации, стандартизации форматирования и проверки DOI.
• Вы работаете в процессе написания на основе LaTeX и нуждаетесь в проверенных, единообразно отформатированных ссылках, которые интегрируются с навыками написания обзоров литературы или научных работ.

• Вам нужна всего одна разовая цитата, и вы можете получить её вручную с сайта издателя быстрее, чем настраивать рабочий процесс.
• В вашем проекте используется стиль цитирования, не основанный на BibTeX (например, форматы только со сносками в некоторых гуманитарных журналах) — этот навык ориентирован на вывод в формате BibTeX.
• Вам необходимо получение полных текстов или управление PDF-файлами; этот навык работает только с метаданными и ссылками, но не с хранением документов.

Поиск в Google Scholar и PubMed программным способом с помощью search_google_scholar.py и search_pubmed.py. Поддерживает расширенные операторы, термины MeSH, фильтры по диапазону дат, фильтры по типу публикации, сортировку по количеству цитирований и экспорт в форматы JSON или BibTeX.

Конвертируйте любую комбинацию DOI, PMID, идентификаторов arXiv или URL-адресов в полные метаданные цитирования с помощью extract_metadata.py. Источники включают CrossRef (DOI), PubMed E-utilities (биомедицина), arXiv API (препринты) и DataCite (наборы данных и программное обеспечение) — все бесплатно, для большинства из них не требуется API-ключ.

Используйте doi_to_bibtex.py для быстрого преобразования одного или нескольких DOI. Принимает список DOI из файла (по одному на строку) и выводит готовый к использованию файл .bib, с дополнительной поддержкой буфера обмена для отдельных записей.

validate_citations.py проверяет разрешение DOI через doi.org и CrossRef, верифицирует обязательные поля для каждого типа записи BibTeX, обнаруживает дубликаты и проверяет синтаксис. Флаг --auto-fix автоматически исправляет типичные ошибки и формирует структурированный отчёт о проверке в формате JSON.

format_bibtex.py стандартизирует порядок полей, отступы, формат имён авторов и регистр заголовков; сортирует записи по ключу, году или автору; удаляет дублирующиеся записи. Создаёт единообразно отформатированные файлы .bib, готовые к компиляции в LaTeX.

Пятиэтапный рабочий процесс — поиск, извлечение метаданных, форматирование BibTeX, валидация и интеграция в текст — полностью поддаётся автоматизации с помощью скриптов. Каждый этап оснащён специализированными инструментами и может быть объединён в единый конвейер: от исходных поисковых запросов до проверенного файла final_references.bib.

Выполните поиск тематически релевантных статей в Google Scholar и PubMed, извлеките метаданные из результатов, добавьте конкретные статьи по DOI, затем последовательно выполните дедупликацию, форматирование и валидацию, чтобы получить готовый к отправке файл .bib для документа LaTeX.

Имея текстовый файл с DOI, собранными в процессе чтения, запустите doi_to_bibtex.py --input dois.txt --output references.bib, чтобы за считанные секунды сгенерировать полноценный файл BibTeX, избегая какого-либо ручного ввода данных.

Пропустите загрязнённый, многоисточный файл .bib через format_bibtex.py для стандартизации и удаления дубликатов, затем через validate_citations.py с флагом --auto-fix, чтобы исправить неработающие DOI, отсутствующие обязательные поля и синтаксические ошибки перед финальной отправкой.

Используйте search_google_scholar.py с параметром --sort-by citations, чтобы найти основополагающие и широко цитируемые статьи по теме, затем передайте результаты через extract_metadata.py для немедленного создания BibTeX-файла с наиболее влиятельными источниками.