Literature Review

• 研究論文、学位論文、または助成金申請のために、システマティック・レビュー、スコーピング・レビュー、またはメタアナリシスを実施する。
• 複数のデータベースおよび出版物の種類にわたって、生物医学、科学、または技術的なトピックに関する現在の知識の状態を統合する。
• 原稿の Literature Review セクションを執筆し、APA、Nature、Vancouver、Chicago、または IEEE スタイルでフォーマットされた検証済み引用文献を必要とする。
• プレプリントサーバーと査読済み文献を同時に検索することで、特定の分野における研究のギャップ、先駆的論文、および今後の方向性を特定する。

• トピックについて、文書化された再現可能な系統的検索ではなく、簡単な背景まとめだけが必要な場合 — 一般的なウェブ検索機能で十分な場合があります。
• あなたの専門分野が生物医学、科学、または技術分野以外である場合、特化したデータベース統合（PubMed、bioRxiv、arXiv など）の恩恵は限られます。
• 引用の検証やPDF出力が不要で、あるテーマについて単に非公式なメモが欲しいだけの場合。

PubMed、bioRxiv、medRxiv、arXiv、Semantic Scholar などを、統合された科学スキル（gget、bioservices、datacommons-client）を通じて横断的に検索します。並列ウェブスキル（parallel-cli search）による学術ドメインフィルタリングを備えた広範な学術ウェブカバレッジにより、主要なソースを見逃すことなく網羅します。

すべての引用はscripts/verify_citations.pyを使用して正確性が検証されます。このスクリプトはDOIを抽出し、CrossRefを通じて解決し、権威あるメタデータを取得します。APA（第7版）、Nature、Vancouver、Chicago、IEEEを含む複数の引用スタイルに対応しています。

scripts/generate_pdf.py を使用して、完成したレビューをmarkdownからプロフェッショナルにフォーマットされたPDFに変換します。pandocとXeLaTeXを使用しており、引用スタイルの選択、目次、セクション番号付けなどのオプションが利用可能です。

レビューを「計画とスコープ設定」「系統的検索」「スクリーニングと選定」「データ抽出と品質評価」「テーマ別統合」「引用文献の検証」「文書生成」の各フェーズに沿って進行させます。PRISMAおよびCochraneのベストプラクティスに準拠しています。

scripts/search_databases.py は、すべてのデータベースからの結果を統合し、DOIまたはタイトルによる重複を削除し、引用数でランク付けを行い、スクリーニング用にマークダウンまたはJSON形式でクリーンな集約結果をエクスポートします。

scientific-schematicsスキルと連携し、PRISMAフローダイアグラム、テーマ統合図、概念的フレームワークなど、出版品質の図表を作成します。デフォルトで色覚障害に配慮した配色と高コントラストに対応しています。

鎌状赤血球症に対するCRISPR遺伝子治療を研究する研究者が、このスキルを活用してMeSH用語とブール演算子を用いてPubMed、bioRxiv、Semantic Scholarを検索し、PICOで定義された採択基準に基づいて数百件の結果をスクリーニングし、データを抽出し、コクランのバイアスリスクツールでバイアスを評価したうえで、Natureスタイルの引用形式を用いたPRISMA準拠のPDFを作成します。

大学院生が論文を執筆する際に、複数のデータベースにわたる検索を実施し、研究ごとではなくテーマ別に調査結果を整理し、すべての引用を確認した上で、再現性のための検索方法論を文書化した、提出可能なフォーマット済みのMarkdownおよびPDFチャプターをエクスポートするためにこのスキルを活用します。

技術系研究者が、parallel-webを通じてarXiv（cs.LG、stat.MLカテゴリ）、Semantic Scholar、および一般的な学術ソースを横断的に検索することで機械学習の文献を調査します。NeurIPSやICMLといったトップカンファレンスの高被引用論文を優先的に取り上げ、研究トレンド、ベンチマーク、および未解決の研究課題を体系的にまとめます。

助成金申請を準備するチームが、このスキルを活用して複数のデータベースにわたる研究領域を迅速にスコープし、主要な先駆的研究と研究上のギャップを特定し、提案書の科学的根拠セクションを支える簡潔で引用が検証された要約文書を生成します。