Citation Management

• Stai costruendo o riorganizzando una bibliografia per un manoscritto, una tesi o una rassegna della letteratura e hai bisogno di convertire DOI, PMID o ID arXiv in voci BibTeX correttamente formattate in blocco.
• Hai bisogno di effettuare ricerche su Google Scholar o PubMed in modo programmatico — incluso il filtraggio per intervallo di date, tipo di pubblicazione o termini MeSH — ed esportare i risultati direttamente in BibTeX.
• Hai un file BibTeX esistente che necessita di deduplicazione, standardizzazione della formattazione e verifica dei DOI prima della sottomissione.
• Stai lavorando in un flusso di scrittura basato su LaTeX e hai bisogno di riferimenti validati e formattati in modo coerente che si integrino con le competenze di rassegna della letteratura o di scrittura scientifica.

• Hai bisogno di una sola citazione occasionale e puoi recuperarla manualmente dal sito di un editore più velocemente di quanto richiederebbe l'impostazione di un flusso di lavoro.
• Il tuo progetto utilizza uno stile di citazione non basato su BibTeX (ad esempio, formati solo a piè di pagina in alcune riviste umanistiche) — questa competenza è orientata all'output BibTeX.
• Hai bisogno del recupero del testo completo o della gestione dei PDF; questa competenza gestisce solo metadati e riferimenti bibliografici, non l'archiviazione dei documenti.

Cerca su Google Scholar e PubMed in modo programmatico utilizzando search_google_scholar.py e search_pubmed.py. Supporta operatori avanzati, termini MeSH, filtri per intervallo di date, filtri per tipo di pubblicazione, ordinamento per numero di citazioni ed esportazione in JSON o BibTeX.

Converti qualsiasi combinazione di DOI, PMID, ID arXiv o URL in metadati di citazione completi utilizzando extract_metadata.py. Le fonti includono CrossRef (DOI), PubMed E-utilities (biomedico), arXiv API (preprint) e DataCite (dataset e software) — tutte gratuite, senza necessità di chiave API per la maggior parte.

Usa doi_to_bibtex.py per una conversione rapida di singoli DOI o in batch. Accetta un elenco di DOI da un file (uno per riga) e genera un file .bib pronto all'uso, con supporto opzionale agli appunti per le singole voci.

validate_citations.py verifica la risoluzione dei DOI tramite doi.org e CrossRef, controlla i campi obbligatori per ogni tipo di voce BibTeX, rileva i duplicati e convalida la sintassi. Un flag --auto-fix corregge automaticamente i problemi più comuni e genera un report di convalida strutturato in formato JSON.

format_bibtex.py standardizza l'ordine dei campi, l'indentazione, il formato dei nomi degli autori e la capitalizzazione dei titoli; ordina le voci per chiave, anno o autore; e rimuove le voci duplicate. Produce file .bib formattati in modo uniforme, pronti per la compilazione LaTeX.

Il flusso di lavoro in cinque fasi — ricerca, estrazione dei metadati, formattazione BibTeX, validazione e integrazione nella scrittura — è completamente automatizzabile tramite script. Ogni fase dispone di strumenti dedicati e può essere combinata in un'unica pipeline, dalla query di ricerca grezza a un file final_references.bib validato.

Cerca su Google Scholar e PubMed articoli rilevanti per l'argomento, estrai i metadati dai risultati, aggiungi articoli specifici tramite DOI, quindi esegui in sequenza la deduplicazione, la formattazione e la validazione per produrre un file .bib pronto per la submission in un documento LaTeX.

Dato un file di testo semplice contenente DOI raccolti durante la lettura, esegui doi_to_bibtex.py --input dois.txt --output references.bib per generare un file BibTeX completo in pochi secondi, evitando qualsiasi inserimento manuale.

Passa un file .bib disordinato e proveniente da più fonti attraverso format_bibtex.py per la standardizzazione e la deduplicazione, poi attraverso validate_citations.py con --auto-fix per risolvere DOI non validi, campi obbligatori mancanti ed errori di sintassi prima della consegna finale.

Usa search_google_scholar.py con --sort-by citations per individuare articoli seminali e altamente citati su un argomento, poi passa i risultati attraverso extract_metadata.py per generare immediatamente un file BibTeX dei riferimenti più influenti.